Beacon Designer 8(设计引物软件) V8.14 免费版 / Beacon Designer破解版
2024-04-24发布者:wx20230305205025大小: 下载:7
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软件介绍
Beacon Designer是一款功能强大的引物设计软件,能够帮助用户轻松建立核苷酸分析、NDA分析等项目,为用户的引物分析工作提供了帮助。因为软件为试用有时间时间限制,所以小编为大家找来了软件的破解版,安装完成即为正式版。
【软件特色】
1、FRET探针
FRET探针-设计出不含二聚体,重复序列和运行序列的最佳FRET探针,以确保信号保真度。
多重FRET探针和引物-检查FRET探针是否与所有引物交叉杂交,以防止多重反应竞争。
评估预先设计的FRET探针和引物-允许使用SYBR®green引物设计最佳的FRET探针。
算法-使用高度精确的SantaLucia最近邻居计算Tm热力学值。
图形视图-显示探针二级结构的图形视图。
2、Scorpions®底漆设计
Scorpions®Primer-设计最佳的标准引物,Scorpions®引物,Probe和Scorpions®,不含二聚体,重复序列和运行序列,可确保信号保真度。
等位基因识别-设计Scorpions®来检测野生和突变等位基因。
MultiplexScorpions®和引物-检查Scorpions®是否具有交叉同源性,所有引物可防止多重反应竞争。
预先设计的Scorpions®引物-允许使用预先设计的探针/引物来设计最佳引物/探针和蝎子。
Tm计算-高精度发夹Tm计算。
图形视图-显示设计的Scorpions®Primer的图形视图。
3、底漆设计
设计引物-设计针对SYBR®Green / Beacon /TaqMan®/ FRET /Scorpions®/ HRMA应用优化的引物对。
算法-使用高度精确的SantaLucia最近邻居热力学值计算引物Tm。
引物等级-根据引物效率对引物进行排名。根据引物的热力学性质和二级结构筛选综合标准引物。
自动引物多路复用-检查引物池中的同源性,以减少引物二聚体。
预先设计的引物-允许将先前设计的引物用于信标,TaqMan®,FRET,HRMA和SYBR®Green分析。
避免模板的二级结构-设计引物时自动避免模板中的二级结构。
避免交叉同源性-通过自动避免使用BLAST发现的同源性来确保信号保真度。
引物扩增子和探针BLAST搜索-BLAST搜索引物,扩增子和探针以验证设计的特异性。
SNP扩增用于信标,TaqMan®,FRET和HRMA化学试剂的引物旨在扩增SNP。 SYBR®Green引物的设计应使区分等位基因的核苷酸位于其中一种引物的3'末端碱基处。可以将HRMA分析设计为扩增SNP和所有其他类型的突变,例如取代,缺失,插入等。
一致的条件-运行中的所有引物均针对相同的PCR反应条件进行了优化。
4、爆炸搜索
选择性cDNA扩增-通过设计跨外显子/外显子和外显子-内含子边界的引物来避免gDNA污染。外显子区域通过解释GenBank标头注释来识别。也可以手动指定它们。
BLAST搜索-BLAST搜索整个序列,设计引物和扩增子以显现特异性。
BLAST数据库-使用独立的BLAST搜索本地自定义数据库,或直接连接到NCBI服务器以获取公共数据库。
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